Liên quan đến công tác trận đấu

Chất lượng mặt sân thi đấu trong hai vòng đầu tiên khiến dư luận bức xúc như sân Lạch Tray, sân Thiên Trường, sân Vinh và sân Thanh Hóa.[22][23][24]

Liên quan đến trọng tài

Ở trận đấu thuộc vòng 3 diễn ra vào lúc 17 giờ ngày 13 tháng 3 năm 2021, Hồng Lĩnh Hà Tĩnh thất bại với tỷ số 0-1 trên sân của SHB Đà Nẵng và sau trận đấu, HLV Phạm Minh Đức cay đắng thốt lên: "Trọng tài Hoan bắt quá kém, phải đi học thêm". Ông Đức cũng chỉ ra rằng: "Trọng tài này dính nhiều phốt lắm rồi". Thực tế, trong hai mùa giải 2019, 2020, khi được tin tưởng giao nhiệm vụ, trọng tài Vũ Phúc Hoan từng nhiều lần dậy sóng bằng những quyết định sai lầm, cả ở cương vị trọng tài chính lẫn trọng tài bàn.

Bạo lực sân cỏ

Ở vòng 5, Ngô Hoàng Thịnh vào bóng bằng cả hai chân với Đỗ Hùng Dũng khiến Hùng Dũng gãy chân và vắng mặt đến hết mùa giải, còn Hoàng Thịnh cũng bị cấm thi đấu đến hết năm 2021. Sau sự việc này, VFF tăng cường xử lý các hành vi bạo lực kể từ vòng 6.

Ban kỷ luật VFF xử lý các cầu thủ Nguyễn Văn Quyết, Bùi Hoàng Việt Anh, Hoàng Vũ Samson, Đồng Văn Trung, Phan Thế Hưng.